O FTP Commander 8.0, é um excelente programa de transferência de arquivos, e o melhor é grátis. Fazer Download Site do Desenvolvedor e veja outros produtos com muito mais recursos.
Após fazer a instalação do FTP Commander >>
clique em New Server
Na próxima tela que abrir faça como o exemplo acima >>
Name: coloque o nome do site >>
FTP Server: coloque ftp.seu domínio >>
FTP Port: deixe como está na porta 21 >>
User ID: seu usuário >>
Password: a sua senha >>
O resto deixe igual ao exemplo
Para se conectar >>
Escolha qual a conta você vai querer se conectar (isto é se tiver mais que uma) >>
Clique em Connect
Após se conectar abra a pasta public_html (lado direito da tela) >>
Abra a pasta onde se encontram os arquivos do site (lado esquerdo da tela) >>
Escolha os arquivos que vão ser enviados para o servidor (ao centro) >>
Clique na seta que indica => o envio do computador para o servidor >> Pronto